This website uses cookies, and the limited processing of your personal data to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy.

Science Education

Formerly known as European Learning Laboratory for the Life Sciences

Our inspiring educational experiences share the scientific discoveries of EMBL with young learners aged 10-19 years and teachers in Europe and beyond. We belong to EMBL’s Science Education and Public Engagement office.

This article is also available in  English,  Čeština,  Français and  Italiano

Μέρος 2ο: Πολλαπλή ευθυγράμμιση πρωτεϊνικών αλληλουχιών

Overview

Πολύ καλά! Στην πρώτο μέρος της εργασίας πιθανότατα ανακάλυψες ότι η άγνωστη πρωτεΐνη ήταν η βόεια ροδοψίνη – το φωτοευαίσθητο μόριο που υπάρχει τον αμφιβληστροειδή. Στη συνέχεια, θέλουμε να μάθουμε περισσότερα για τις πρωτεΐνες αυτής της οικογένειας μακρομορίων και να διαπιστώσουμε αν η Βιοπληροφορική μπορεί να μας βοηθήσει να ανακαλύψουμε πληροφορίες σχετικές με τη βιοχημεία τους και την εξέλιξή τους.

Για αυτό το σκοπό, θα κατασκευάσουμε μια πολλαπλή ευθυγράμμιση αλληλουχιών. Αυτό σημαίνει ότι θα χρησιμοποιήσουμε πολλές αλληλουχίες αμινοξέων (τις οποίες θα μπορούσαμε, για παράδειγμα, να λάβουμε μέσω της χρήσης πληροφοριών από τα αποτελέσματα του εργαλείου BLAST) και να τις ευθυγραμμίσουμε με τέτοιον τρόπο ώστε τα όμοια αμινοξικά κατάλοιπα να τοποθετούνται το ένα κάτω από το άλλο.

Μπορείς να βρεις μια σειρά από έτοιμες αλληλουχίες στο πεδίο “Αλληλουχίες”. Η πρώτη είναι η Βόεια ροδοψίνη με την οποία δούλεψες στο 1ο μέρος. Θα χρησιμοποιήσουμε το εργαλείο πολλαπλής ευθυγράμμισης αλληλουχιών του EMBL-EBI MUSCLE, για να δημιουργήσουμε μια πολλαπλή ευθυγράμμιση αλληλουχιών.

Share: