{"id":29376,"date":"2015-10-05T20:05:57","date_gmt":"2015-10-05T18:05:57","guid":{"rendered":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/"},"modified":"2021-06-18T14:46:46","modified_gmt":"2021-06-18T14:46:46","slug":"step-5-structure-of-gfp","status":"publish","type":"teachingbase","link":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/?lang=it","title":{"rendered":"Step 5: Struttura della GFP"},"content":{"rendered":"\n<div class=\"vf-tabs\"><ul class=\"vf-tabs__list\" data-vf-js-tabs=\"true\"><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-74c95bab-501c-4bc2-bc5c-4bd79038234c\">Descrizione <\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-1a6bebfa-8428-433f-9cfc-6506b7154097\">Il tuo compito<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-4c7c5382-9083-47d1-8a64-9c108e184908\">PDBe<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-04943c3b-3a86-4fec-b356-e6cb9688f09d\">Domande<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-d7a4ed6c-a6b9-4bbf-9b2a-28eb7cacd6a2\">Liste attivita<\/a><\/li><\/ul><div class=\"vf-tabs-content\" data-vf-js-tabs-content=\"true\">\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-74c95bab-501c-4bc2-bc5c-4bd79038234c\"><h2>Descrizione <\/h2>\n<p>Nella parte finale dell&#8217;attivit\u00e0, utilizzeremi il sito the Protein Data Bank Europe (PDBe) per visualizzare una struttura tridimensionale interattiva della GFP e divertirsi a manipolarla.<\/p>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-1a6bebfa-8428-433f-9cfc-6506b7154097\"><h2>Il tuo compito<\/h2>\n<p><strong>Procedere come descritto sotto:<\/strong><\/p>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Aprite la tabulazione &#8220;PDBe&#8221;.<\/li><li>Cercate <strong>Green Fluorescent Protein<\/strong>, <strong>GFP<\/strong>, oppure <strong>1GFL<\/strong>.<\/li><li>Seguite le istruzioni nella tabulazione &#8220;PDBe&#8221; e cercate di rispondere alle domande.<\/li><\/ol>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-4c7c5382-9083-47d1-8a64-9c108e184908\"><h2>PDBe<\/h2>\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Apri il link in una nuova finestra del browser: <a href=\"https:\/\/www.ebi.ac.uk\/pdbe\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">https:\/\/www.ebi.ac.uk\/pdbe\/<\/a><\/li><li>Nel box di ricerca digitate <strong>Green Fluorescent Protein<\/strong>, <strong>GFP<\/strong>, oppure <strong>1GFL<\/strong> e cliccate sul bottone <strong>&#8220;Search&#8221;<\/strong>.<\/li><li>Siete stati indirizzati ai risultati per la proteina verde fluorescente (GFP) in PDBe. Se cliccate sull&#8217; immagine di una delle strutture proteiche aprirete un visualizzatore 3D interattivo (in alternativa, cliccate su &#8220;View in 3D&#8221; e poi selezionate &#8220;Astex Viewer&#8221;). Potreste visualizzare una richiesta di attivazione di Java. Visualizzerete la struttura tridimensionale a nastri della GFP. Potete usare il cursore per ruotare la struttura. Le impostazioni selezionate (per esempio il tipo di rappresentazione o il colore) possono essere modificate o usando il menu sulla sinistra o cliccando con il pulsante destro sull&#8217;immagine.<\/li><\/ol>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-04943c3b-3a86-4fec-b356-e6cb9688f09d\"><h2>Domande<\/h2>\n<p>Divertitevi con la struttura tridimensionale interattiva e cercate di rispondere alle domande seguenti:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>A che cosa somiglia la forma della molecola GFP?<\/li><li>Potete individuare il cromoforo nella struttura molecolare?<\/li><li>Che effetti potrebbe avere una mutazione sulla funzione della proteina?<\/li><\/ul>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-d7a4ed6c-a6b9-4bbf-9b2a-28eb7cacd6a2\"><h2>Liste attivita<\/h2>\n<p><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/?lang=it\">Caccia al tesoro GFP<\/a><\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/gfp-treasure-hunt-introduction\/?lang=it\">Caccia al tesoro GFP \u2013 Introduzione<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-1-database-search\/?lang=it\">Step 1: Ricerca nel database<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-2-comparison-of-nucleotide-sequences\/?lang=it\">Step 2: Confronto di sequenze nucleotidiche<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-3-translation-of-mrnas\/?lang=it\">Step 3: Traduzione degli mRNA<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-4-comparison-of-amino-acid-sequences\/?lang=it\">Step 4: Confronto di sequenze aminoacidiche<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/?lang=it\">Step 5: Struttura della GFP<\/a><\/li><\/ul>\n<\/section>\n<\/div><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"featured_media":29377,"parent":28290,"menu_order":1,"template":"","class_list":["post-29376","teachingbase","type-teachingbase","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase\/29376","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/types\/teachingbase"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase\/28290"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/media\/29377"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=29376"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}