{"id":29372,"date":"2015-10-05T20:05:57","date_gmt":"2015-10-05T18:05:57","guid":{"rendered":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/"},"modified":"2021-06-18T14:46:38","modified_gmt":"2021-06-18T14:46:38","slug":"step-5-structure-of-gfp","status":"publish","type":"teachingbase","link":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/?lang=fr","title":{"rendered":"\u00c9tape 5: Structure de la GFP"},"content":{"rendered":"\n<div class=\"vf-tabs\"><ul class=\"vf-tabs__list\" data-vf-js-tabs=\"true\"><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-74c95bab-501c-4bc2-bc5c-4bd79038234c\">Aper\u00e7u<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-1a6bebfa-8428-433f-9cfc-6506b7154097\">Votre t\u00e2che<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-4c7c5382-9083-47d1-8a64-9c108e184908\">PDBe<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-04943c3b-3a86-4fec-b356-e6cb9688f09d\">Questions<\/a><\/li><li class=\"vf-tabs__item\"><a class=\"vf-tabs__link\" href=\"#vf-tabs__section-d7a4ed6c-a6b9-4bbf-9b2a-28eb7cacd6a2\">Navigation d&#8217;activit\u00e9<\/a><\/li><\/ul><div class=\"vf-tabs-content\" data-vf-js-tabs-content=\"true\">\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-74c95bab-501c-4bc2-bc5c-4bd79038234c\"><h2>Aper\u00e7u<\/h2>\n<p>Dans la derni\u00e8re partie de l&#8217;activit\u00e9, nous utiliserons la Protein Data Bank Europe (PDBe) pour visualiser un mod\u00e8le de structure interactive de GFP en 3D avec lequel nous nous amuserons un peu.<\/p>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-1a6bebfa-8428-433f-9cfc-6506b7154097\"><h2>Votre t\u00e2che<\/h2>\n<p><strong>Suivez la proc\u00e9dure suivante :<\/strong><\/p>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Cliquez sur l&#8217;onglet &#8220;PDBe&#8221;.<\/li><li>Cherchez <strong>Prot\u00e9ine \u00e0 fluorescence verte<\/strong> <strong>GFP<\/strong>, ou <strong>1GFL<\/strong>.<\/li><li>Suivez les instructions sous l&#8217;onglet &#8220;PDBe&#8221; et essayez de r\u00e9pondre aux questions relatives \u00e0 la t\u00e2che.<\/li><\/ol>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-4c7c5382-9083-47d1-8a64-9c108e184908\"><h2>PDBe<\/h2>\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Ouvrir le lien dans une nouvelle fen\u00eatre de navigateur: <a href=\"https:\/\/www.ebi.ac.uk\/pdbe\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">https:\/\/www.ebi.ac.uk\/pdbe\/<\/a><br><\/li><li>Dans la zone de recherche, saisissez <strong>Prot\u00e9ine \u00e0 fluorescence verte<\/strong>, <strong>GFP<\/strong>, ou <strong>1GFL<\/strong> et appuyez sur le bouton <strong>&#8220;Rechercher&#8221;<\/strong>.<\/li><li>Vous serez alors redirig\u00e9 vers les r\u00e9sultats obtenus pour la recherche &#8220;Prot\u00e9ine \u00e0 fluorescence verte&#8221; (GFP) dans la PDBe. En cliquant sur l&#8217;une des images des structures de prot\u00e9ines, vous pouvez ouvrir la visionneuse interactive de prot\u00e9ines 3D (vous pouvez aussi cliquer sur &#8220;Voir en 3D&#8221;, puis s\u00e9lectionner la &#8220;Visionneuse Astex&#8221;). Veuillez noter qu&#8217;il est possible qu&#8217;\u00e0 cette \u00e9tape, le syst\u00e8me vous demande une autorisation d&#8217;utilisation Java. Vous pouvez maintenant voir un mod\u00e8le 3D en carton de la structure de la GFP. Vous pouvez utiliser votre curseur pour effectuer une rotation de la structure. Les options choisies (telles que le type de repr\u00e9sentation structurel ou la couleur) peuvent \u00eatre modifi\u00e9es en utilisant le menu de gauche ou en effectuant un clic droit sur l&#8217;image.<\/li><\/ol>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-04943c3b-3a86-4fec-b356-e6cb9688f09d\"><h2>Questions<\/h2>\n<p>Amusez-vous \u00e0 faire tourner le mod\u00e8le interactif 3D de la structure de la prot\u00e9ine et essayez de r\u00e9pondre \u00e0 quelques-unes des questions suivantes :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>\u00c0 quoi ressemble la forme de la mol\u00e9cule de la GFP ?<\/li><li>Pouvez-vous trouver le chromophore de la structure mol\u00e9culaire ?<\/li><li>Quel effet peut entra\u00eener une mutation sur la fonction de la prot\u00e9ine ?<\/li><\/ul>\n<\/section>\n\n\n\n<section class=\"vf-tabs__section\" id=\"vf-tabs__section-d7a4ed6c-a6b9-4bbf-9b2a-28eb7cacd6a2\"><h2>Navigation d&#8217;activit\u00e9<\/h2>\n<p><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/?lang=fr\">Chasse au tr\u00e9sor GFP<\/a><\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/gfp-treasure-hunt-introduction\/?lang=fr\">Chasse au tr\u00e9sor GFP \u2013 Introduction<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-1-database-search\/?lang=fr\">\u00c9tape 1: Recherche avec bases de donn\u00e9es<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-2-comparison-of-nucleotide-sequences\/?lang=fr\">\u00c9tape 2: Comparaison des s\u00e9quences de nucl\u00e9otides<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-3-translation-of-mrnas\/?lang=fr\">\u00c9tape 3 : Traduction de l&#8217;ARN messager<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-4-comparison-of-amino-acid-sequences\/?lang=fr\">\u00c9tape 4 : Comparaison des s\u00e9quences d&#8217;acides amin\u00e9s<\/a><\/li><li><a href=\"https:\/\/www.embl.org\/ells\/teachingbase\/gfp-treasure-hunt\/step-5-structure-of-gfp\/?lang=fr\">\u00c9tape 5: Structure de la GFP<\/a><\/li><\/ul>\n<\/section>\n<\/div><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"featured_media":29373,"parent":28286,"menu_order":1,"template":"","class_list":["post-29372","teachingbase","type-teachingbase","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase\/29372","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/types\/teachingbase"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/teachingbase\/28286"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/media\/29373"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.embl.org\/ells\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=29372"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}